Агароза против полиакриламида
Агароза и полиакриламид являются водорастворимыми полимерами, но между ними можно увидеть много различий, начиная с их происхождения. И агароза, и полиакриламид имеют нечто общее в их способности образовывать пористые гелевые матрицы. Несмотря на это, между ними существует ряд явных различий. Основные различия между этими двумя полимерами заключаются в их природе происхождения, химической структуре, их различном использовании и их характеристиках с точки зрения гель-электрофореза.
Что такое агароза?
Агароза - это встречающийся в природе линейный полимер, который, в свою очередь, получен из сложного полимера, называемого агаром, который содержится в морских водорослях. Агароза извлекается из агара путем удаления его белкового компонента, называемого агаропектином. Агароза - это то, что придает агару способность образовывать гели.
Основное применение агарозы - в микробиологических и молекулярно-биологических исследованиях. В микробиологических исследованиях агароза при добавлении подходящих питательных веществ обеспечивает прочную основу для культивирования таких микроорганизмов, как бактерии и грибы. При использовании в полутвердых концентрациях он может быть полезен для оценки подвижности этих микроорганизмов. В молекулярной биологии он служит важным инструментом для одного из самых фундаментальных процессов разрешения, называемого «гель-электрофорезом» или «электрофорезом в агарозном геле» (AGE). Гель-электрофорез - это процесс, который позволяет разделить или разделить нуклеиновые кислоты или белок в зависимости от их размера и заряда. Здесь агароза служит пористым гелем, похожим на сито, через который происходит разделение.
Структура агарозы
Что такое полиакриламид?
Полиакриламид - это синтетический полимер, который используется в самых разных отраслях промышленности. Как упоминалось ранее, его использование зависит от его способности образовывать гели. Однако, помимо этого, его способность удерживать и отводить воду при различных концентрациях также используется в различных отраслях промышленности.
Чаще всего полиакриламид используется для очистки сточных вод. Здесь он используется как флокулянт для удаления любых взвешенных органических веществ; следовательно, улучшение мутности и осветление воды. Еще одно применение полиакриламида - в бумажной промышленности. Здесь он используется для удержания или слива воды из бумажной массы по мере необходимости. Точно так же в сельском хозяйстве и строительстве он используется в качестве кондиционера почвы для предотвращения эрозии почвы и улучшения ее качества.
Как и агароза, полиакриламид также используется в молекулярной биологии в качестве важного инструмента разрешения в аналогичном процессе, который называется «электрофорез в полиакриламидном геле» (PAGE). В дополнение ко всему этому полиакриламид также используется при переработке руды и производстве флокулирующего агента для удаления любых взвешенных органических материалов; следовательно, улучшение мутности и осветление воды. Еще одно применение полиакриламида - в бумажной промышленности. Здесь он используется для удержания или слива воды из бумажной массы по мере необходимости. Точно так же в сельском хозяйстве и строительстве он используется в качестве кондиционера почвы для предотвращения эрозии почвы и улучшения ее качества. В дополнение ко всему этому, полиакриламид также используется в производстве пищевых добавок, мягких контактных линз и текстиля.
Структура полиакриламида
В чем разница между агарозой и полиакриламидом?
Происхождение агарозы и полиакриламида:
Агароза: Агароза - это полимер природного происхождения. Его получают из морских водорослей.
Полиакриламид: Полиакриламид имеет синтетическое происхождение и не встречается ни в каких естественных условиях.
Молекулярная формула агарозы и полиакриламида:
Агароза: молекулярная формула агарозы C 24 H 38 O 19.
Полиакриламид: молекулярная формула полиакриламида (C 3 H 5 NO) n.
Химическая структура агарозы и полиакриламида:
Агароза: Агароза - линейный полисахарид. Он состоит из повторяющихся дисахаридных единиц, называемых агробиозой, которые удерживаются вместе водородными связями.
Полиакриламид: полиакриламид представляет собой химически сшитый полимер. Он состоит из мономеров акриламида и сшивающего агента N, N'-метиленбисакриламида.
Токсичность агарозы и полиакриламида:
Агароза: агароза и ее мономерное звено агробиозы нетоксичны по своей природе.
Полиакриламид: мономерное звено полиакриламида, акриламид, является предполагаемым канцерогеном и известным нейротоксином, в то время как его полимеризованная форма не токсична по своей природе.
Характеристики агарозного и полиакриламидного гелей:
ВОЗРАСТ и СТРАНИЦА:
Агароза: приготовление агарозного геля для AGE требует меньше времени, легко и просто, и не требует инициатора или катализатора полимеризации.
Полиакриламид: приготовление полиакриламидного геля для PAGE занимает много времени и утомительно, а также требует инициатора (персульфат аммония) и катализатора полимеризации (N, N, N ', N'-тетраметилэтилендиамин - TEMED).
Природа:
Гели полиакриламида химически более стабильны, чем гели агарозы.
Размер пор:
При одинаковой концентрации матрицы полиакриламидного геля имеют тенденцию иметь меньшие размеры пор по сравнению с матрицей геля агарозы.
Изменение размера пор:
Размер пор полиакриламидных гелей можно изменять более контролируемым образом, чем размер пор агарозных гелей.
Разрешающая способность:
Гели полиакриламида обладают высокой разрешающей способностью, а гели агарозы имеют низкую разрешающую способность.
Аккомодационная нуклеиновая кислота:
Гели полиакриламида могут содержать большее количество нуклеиновой кислоты, чем гели агарозы для средств разделения.
Изображения предоставлены: Агароза и структура полиакриламида через Wikicommons (общественное достояние)