Ключевое различие между поринами и аквапоринами заключается в том, что порины представляют собой заполненные водой поры и каналы, обнаруженные в мембранах бактерий и эукариот. Между тем, аквапорины - это мембранные белки, которые образуют водоразборные каналы в живых клетках.
Различные молекулы входят в клетку и выходят из нее через плазматическую мембрану живых организмов. Таким образом, в плазматической мембране существуют различные мембранные белки, которые поддерживают и регулируют молекулы, входящие и выходящие из клеток. Порины и аквапорины - два таких типа мембранных белков. Из них порины представляют собой поры, заполненные водой, которые способствуют транспортировке гидрофильных молекул через мембрану. Между тем, аквапорины - это каналы, селективные к воде, которые позволяют воде свободно проходить через мембрану.