Ключевое различие между генокопией и фенокопией состоит в том, что в генокопии фенотипы демонстрируют сходство, а генотип изменяется, тогда как при фенокопии фенотипы различаются, а генотип остается неизменным.
Несоответствие между генокопией и фенокопией связано с объяснением редких проявлений генетики. Эти две концепции демонстрируют, как традиционная генетика или менделевская генетика могут варьироваться в зависимости от исключений в природе. Генокопия относится к феномену получения сходного фенотипа, несмотря на наличие другого генотипа. Напротив, фенокопия относится к феномену наличия различных фенотипов, несмотря на то, что генотип остается неизменным.