Ключевое различие - RNASE A против RNASE H
Рибонуклеазы - это нуклеазы, которые специфически расщепляют РНК на более мелкие единицы. Их можно разделить на две категории; эндорибонуклеазы и экзорибонуклеазы. Эндорибонуклеаза - это эндонуклеаза, способная разрушать одноцепочечную или двухцепочечную РНК. Он расщепляет фосфодиэфирные связи в полинуклеотидной цепи РНК. Примерами являются РНКаза А, РНКаза III, РНКаза Т1, РНКаза Р и РНКаза Н. Экзорибонуклеаза представляет собой экзонуклеазу, которая разрушает РНК путем удаления концевых нуклеотидов с 5'-конца или 3'-конца молекулы РНК. Примерами являются РНКаза R, РНКаза II, РНКаза D и РНКаза PH. Ключевое различие между РНКазой А и РНКазой Н заключается в том, что РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет одноцепочечную РНК на более мелкие компоненты, в то время как РНКаза Н является неспецифическим ферментом, который расщепляет РНК в гибриде РНК-ДНК на более мелкие единицы посредством гидролитический механизм.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные различия
2. Что такое RNASE A
3. Что такое RNASE H
4. Сходства между RNASE A и RNASE H
5. Параллельное сравнение - RNASE A и RNASE H в табличной форме
6. Резюме
Что такое RNASE A?
РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет непарные остатки цитозина и урацила на 3'-конце одноцепочечной РНК. РНКаза H работает при более высокой концентрации соли (0,3 М или более высокая концентрация NaCl). Гидролитическая реакция состоит из двух стадий. Он образует 3 'фосфорилированный продукт через 2', 3 'циклический монофосфатный промежуточный продукт. Хотя он специфичен для одноцепочечной РНК при более высокой концентрации соли, он также может разрушать двухцепочечную РНК и РНК в гибриде РНК-ДНК при более низкой концентрации NaCl (ниже 0,3 М NaCl).
Брюс Меррифилд первым синтезировал этот фермент. РНКаза А - очень популярный фермент в молекулярных исследованиях. РНКаза А поджелудочной железы крупного рогатого скота является примером РНКазы А. Это один из самых выносливых ферментов, используемых в лаборатории. Этот фермент не нуждается в кофакторе для своей активности. Это очень термостабильный фермент. РНКаза А - это первый фермент и третий белок, для которых была определена правильная аминокислотная последовательность. Этот фермент очень маленький: 124 аминокислоты и молекулярная масса 12600 Да. И он имеет четыре остатка гистидина (His 12 и His 119, которые участвуют в каталитической реакции).
Рисунок 01: РНКаза A
РНКазу А можно выделить путем кипячения неочищенного образца. При кипении все другие ферменты расщепляют оставшуюся РНКазу А. РНКаза А - удивительно стабильный фермент. Этот фермент ингибирует с помощью ингибитора рибонуклеазы белковые комплексы тяжелых металлов и уридин-ванадат.
Что такое РНКаза H?
РНКаза Н - это неспецифический фермент рибонуклеаза, который может разрушать РНК в гибриде РНК-ДНК посредством гидролитической реакции. РНКаза H расщепляет 3'-OP-связь РНК в гибриде РНК-ДНК. В конечном итоге он производит продукты с концевыми группами 3'OH и 5'-фосфатов. В репликации ДНК он играет ключевую роль, удаляя праймер РНК после образования новых цепей ДНК. В лабораторных условиях он специфически разрушает РНК в гибриде РНК-ДНК, но не ДНК и негибридизованную РНК. И этот фермент обычно используется для разрушения матрицы РНК после образования первой комплементарной цепи ДНК во время синтеза кДНК.
Рисунок 02: РНКаза H
РНКаза Н также используется в анализах защиты от нуклеаз. Он также может быть включен в удаление поли А-хвоста из мРНК. РНКаза H обладает способностью разрушать некодирующую РНК внутри и вне клетки. Ионы металлов необходимы в качестве кофакторов для этой белковой активности. Хелатор (EDTA) можно использовать для ингибирования фермента РНКазы Н.
Каковы сходства между RNASE A и RNASE H?
- Оба белка по своей природе.
- Оба являются эндорибонуклеазой.
- Оба могут разрушать РНК.
- Оба проводят гидролитические реакции.
- Молекулярные лаборатории используют и то, и другое.
В чем разница между RNASE A и RNASE H?
Различать статью в середине перед таблицей
RNASE A против RNASE H |
|
| РНКаза A представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет 3'-конец неспаренных остатков цитозина и урацила одноцепочечной РНК при более высокой концентрации соли. | РНКаза H - это неспецифический фермент рибонуклеаза, который может разрушать РНК в гибриде РНК-ДНК посредством гидролитической реакции. |
| Природа расщепления РНК | |
| РНКаза А специфически расщепляет одноцепочечную РНК при более высокой концентрации соли. | РНКаза Н расщепляет РНК в гибриде РНК-ДНК. |
| Необходимость сопутствующих факторов для деятельности | |
| РНКаза A не нуждается в кофакторах для своей активности. | РНКазе Н необходимы ионы металлов в качестве кофакторов для своей активности. |
| Ингибиторы активности белков | |
| Белок-ингибитор рибонуклеазы, комплексы тяжелых металлов и уридин-ванадат подавляют активность РНКазы А. | Хелатор (EDTA) ингибирует активность РНКазы H. |
| Удаление праймера РНК при репликации ДНК | |
| РНКаза А не используется для удаления праймера РНК при репликации ДНК. | РНКаза H используется для удаления праймера РНК при репликации ДНК. |
| Удаление матрицы ДНК при синтезе комплементарной ДНК (C-ДНК) | |
| РНКаза A не используется для удаления матрицы РНК во время синтеза комплементарной ДНК (C-ДНК). | РНКаза H используется для удаления матрицы РНК во время синтеза комплементарной ДНК (C-ДНК). |
| Удаление поли-A-хвоста в мРНК, гибридизированной с олиго (dt) | |
| РНКаза A не используется для удаления «поли-A-хвоста» в мРНК, гибридизированной с олиго (dt). | РНКаза H используется для удаления «поли-A-хвоста» в мРНК, гибридизированной с олиго (dt). |
Резюме - RNASE A против RNASE H
Рибонуклеазы представляют собой ферменты нуклеазы, которые способны расщеплять РНК на более мелкие единицы. Они бывают двух типов; эндорибонуклеазы и экзорибонуклеазы. Эндорибонуклеаза - это эндонуклеаза, способная расщеплять одноцепочечную или двухцепочечную РНК. И он расщепляет фосфодиэфирную связь в полинуклеотидной цепи РНК. РНКаза А и РНКаза Н - две эндорибонуклеазы. РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет неспаренные остатки цитозина и урацила на 3'-конце одноцепочечной РНК при более высокой концентрации соли. РНКаза H - это неспецифический фермент рибонуклеаза, который может разрушать РНК в гибриде РНК-ДНК посредством гидролитической реакции. В этом разница между РНКазой А и РНКазой H.
Скачать PDF RNASE A vs RNASE H
Вы можете загрузить PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономных целях в соответствии с примечанием к цитированию. Пожалуйста, скачайте PDF-версию здесь. Разница между RNASE A и RNASE H
