Ключевое различие - генотипирование против секвенирования
Генотипирование и секвенирование - это два метода, выполняемые для получения информации о нуклеиновых кислотах, в основном о ДНК организма. Ключевое различие между генотипированием и секвенированием состоит в том, что генотипирование - это процесс определения генетического варианта, которым обладает человек, с использованием маркеров, в то время как секвенирование - это определение правильного порядка нуклеотидной последовательности в данном фрагменте ДНК.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные различия
2. Что такое генотипирование
3. Что такое секвенирование
4. Сравнение бок о бок - генотипирование и секвенирование
5. Резюме
Что такое генотипирование?
Генотипирование - это определение генетического состава человека с использованием последовательности ДНК и маркеров, а также сравнение и идентификация его наследования. Генотипирование важно в эволюционной биологии, популяционной биологии, таксономии, экологии и генетике организмов. Это может быть выполнено различными методами, включая секвенирование ДНК, полимеразную цепную реакцию, полиморфизм длины рестрикционного фрагмента (RFLP), случайное амплифицированное полиморфное обнаружение, полиморфизм длины амплифицированного фрагмента (AFLP), микроматрицы ДНК и т.
Генотипирование включает в себя секвенирование определенных небольших фрагментов последовательностей ДНК и обнаружение родства генетического состава с другими людьми с использованием генетических маркеров. Он определяет однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) среди людей или конкретных аллелей. Генотипирование применимо к широкому кругу организмов, включая человека. Он также применим к микроорганизмам, таким как вирусы, грибы и т. Д., И может использоваться для определения их генетических вариантов с помощью эталонных профилей. В молекулярной эпидемиологии и судебной микробиологии борьба с патогенами, особенно с микроорганизмами, осуществляется с помощью информации, полученной в результате генотипирования. Генотипирование очень важно при анализе родословных. Генотипирование людей подтверждает материнство и отцовство. Генотип выявит доминантные и рецессивные аллели генов, определяющих конкретные признаки.
Рисунок_1: Генотипирование RFLP
Что такое секвенирование?
Секвенирование - это процесс определения правильного порядка расположения нуклеотидов в данном фрагменте ДНК или РНК. Практически вся информация, необходимая для роста и развития организма, закодирована в его геноме. Доступность методов для получения и разделения фрагментов нуклеиновых кислот длиной в несколько сотен нуклеотидов привела к разработке процедур определения точной нуклеотидной последовательности данного фрагмента ДНК или РНК. Сегодня доступны различные типы методов секвенирования. Эти методы секвенирования вместе с технологиями построения библиотек геномов, представляющих весь геном организма, облегчают секвенирование всего генома этого организма, делая углубленный анализ структур генов, функций генов, местоположения генов, экспрессии генов, картирование генов, регуляторные области генов и т. д.
Полные геномы многих вирусов, нескольких бактерий, архебактерий, дрожжей и некоторых других организмов секвенированы и нанесены на карту. Проект «Геном человека» позволил секвенировать и нанести на карту весь геном человека и опубликовать его первый проект в 2003 году. Это важная веха в развитии биологии. Последовательности генома человека в настоящее время используются в медицинском секторе для выявления генетических причин редких заболеваний, скрининга риска заболеваний у новорожденных, выявления генетических деталей различных видов рака, разработки новых терапевтических средств, разработки новых диагностических инструментов и т. Д.
В мире растений секвенировали геном риса и геномы арабидопсиса. Знание этих последовательностей, несомненно, изменит наше понимание того, как функционируют клетки и организмы.
Рисунок_2: Авторадиография секвенирования по Сэнгеру
В чем разница между генотипированием и секвенированием?
Различать статью в середине перед таблицей
Генотипирование против секвенирования |
|
| Генотипирование - это процесс определения генетического состава человека и проверки группы или таксономии этого организма. | Секвенирование - это процесс определения точного порядка расположения нуклеотидов в данном фрагменте ДНК или РНК. |
| Методы | |
| ПДРФ, секвенирование генов, ПЦР, ДНК-микрочипы, AFLP и т. Д. | Секвенирование по Сэнгеру, секвенирование по Гилберту, пиросеквенирование, секвенирование следующего поколения, секвенирование дробовиком и т. Д. |
| Основные проблемы | |
| Это больше касается того, дают ли различия генотипов фактические различия фенотипа. | Это больше касается порядка нуклеотидов и его различий и изменений с другими организмами. |
Резюме - Генотипирование против секвенирования
Генотипирование и секвенирование полезны для изучения генетической информации организмов. Генотипирование - это процесс определения вариаций генотипа среди людей и определения их категорий. Секвенирование - это процесс определения правильного порядка нуклеотидов в интересующем фрагменте или области ДНК. Оба метода предоставляют важную информацию о генах и геномах.
