Разница между генотипированием и секвенированием

Оглавление:

Разница между генотипированием и секвенированием
Разница между генотипированием и секвенированием

Видео: Разница между генотипированием и секвенированием

Видео: Разница между генотипированием и секвенированием
Видео: Геномное или полноэкзомное секвенирование: в чем разница? 2024, Май
Anonim

Ключевое различие - генотипирование против секвенирования

Генотипирование и секвенирование - это два метода, выполняемые для получения информации о нуклеиновых кислотах, в основном о ДНК организма. Ключевое различие между генотипированием и секвенированием состоит в том, что генотипирование - это процесс определения генетического варианта, которым обладает человек, с использованием маркеров, в то время как секвенирование - это определение правильного порядка нуклеотидной последовательности в данном фрагменте ДНК.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные различия

2. Что такое генотипирование

3. Что такое секвенирование

4. Сравнение бок о бок - генотипирование и секвенирование

5. Резюме

Что такое генотипирование?

Генотипирование - это определение генетического состава человека с использованием последовательности ДНК и маркеров, а также сравнение и идентификация его наследования. Генотипирование важно в эволюционной биологии, популяционной биологии, таксономии, экологии и генетике организмов. Это может быть выполнено различными методами, включая секвенирование ДНК, полимеразную цепную реакцию, полиморфизм длины рестрикционного фрагмента (RFLP), случайное амплифицированное полиморфное обнаружение, полиморфизм длины амплифицированного фрагмента (AFLP), микроматрицы ДНК и т.

Генотипирование включает в себя секвенирование определенных небольших фрагментов последовательностей ДНК и обнаружение родства генетического состава с другими людьми с использованием генетических маркеров. Он определяет однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) среди людей или конкретных аллелей. Генотипирование применимо к широкому кругу организмов, включая человека. Он также применим к микроорганизмам, таким как вирусы, грибы и т. Д., И может использоваться для определения их генетических вариантов с помощью эталонных профилей. В молекулярной эпидемиологии и судебной микробиологии борьба с патогенами, особенно с микроорганизмами, осуществляется с помощью информации, полученной в результате генотипирования. Генотипирование очень важно при анализе родословных. Генотипирование людей подтверждает материнство и отцовство. Генотип выявит доминантные и рецессивные аллели генов, определяющих конкретные признаки.

Разница между генотипированием и секвенированием
Разница между генотипированием и секвенированием

Рисунок_1: Генотипирование RFLP

Что такое секвенирование?

Секвенирование - это процесс определения правильного порядка расположения нуклеотидов в данном фрагменте ДНК или РНК. Практически вся информация, необходимая для роста и развития организма, закодирована в его геноме. Доступность методов для получения и разделения фрагментов нуклеиновых кислот длиной в несколько сотен нуклеотидов привела к разработке процедур определения точной нуклеотидной последовательности данного фрагмента ДНК или РНК. Сегодня доступны различные типы методов секвенирования. Эти методы секвенирования вместе с технологиями построения библиотек геномов, представляющих весь геном организма, облегчают секвенирование всего генома этого организма, делая углубленный анализ структур генов, функций генов, местоположения генов, экспрессии генов, картирование генов, регуляторные области генов и т. д.

Полные геномы многих вирусов, нескольких бактерий, архебактерий, дрожжей и некоторых других организмов секвенированы и нанесены на карту. Проект «Геном человека» позволил секвенировать и нанести на карту весь геном человека и опубликовать его первый проект в 2003 году. Это важная веха в развитии биологии. Последовательности генома человека в настоящее время используются в медицинском секторе для выявления генетических причин редких заболеваний, скрининга риска заболеваний у новорожденных, выявления генетических деталей различных видов рака, разработки новых терапевтических средств, разработки новых диагностических инструментов и т. Д.

В мире растений секвенировали геном риса и геномы арабидопсиса. Знание этих последовательностей, несомненно, изменит наше понимание того, как функционируют клетки и организмы.

Основное отличие - генотипирование против секвенирования
Основное отличие - генотипирование против секвенирования

Рисунок_2: Авторадиография секвенирования по Сэнгеру

В чем разница между генотипированием и секвенированием?

Различать статью в середине перед таблицей

Генотипирование против секвенирования

Генотипирование - это процесс определения генетического состава человека и проверки группы или таксономии этого организма. Секвенирование - это процесс определения точного порядка расположения нуклеотидов в данном фрагменте ДНК или РНК.
Методы
ПДРФ, секвенирование генов, ПЦР, ДНК-микрочипы, AFLP и т. Д. Секвенирование по Сэнгеру, секвенирование по Гилберту, пиросеквенирование, секвенирование следующего поколения, секвенирование дробовиком и т. Д.
Основные проблемы
Это больше касается того, дают ли различия генотипов фактические различия фенотипа. Это больше касается порядка нуклеотидов и его различий и изменений с другими организмами.

Резюме - Генотипирование против секвенирования

Генотипирование и секвенирование полезны для изучения генетической информации организмов. Генотипирование - это процесс определения вариаций генотипа среди людей и определения их категорий. Секвенирование - это процесс определения правильного порядка нуклеотидов в интересующем фрагменте или области ДНК. Оба метода предоставляют важную информацию о генах и геномах.

Рекомендуем: