Разница между контигом и скаффолдом

Разница между контигом и скаффолдом
Разница между контигом и скаффолдом

Видео: Разница между контигом и скаффолдом

Видео: Разница между контигом и скаффолдом
Видео: Сборка геномов de novo. 2024, Март
Anonim

Ключевое различие между контигом и каркасом состоит в том, что у контига нет промежутков, в то время как каркас состоит из контигов и промежутков.

Секвенирование генома многоклеточных организмов очень сложно по сравнению с секвенированием одноклеточных организмов. Секвенирование всего генома - это простой и быстрый метод секвенирования многоклеточных геномов. Это метод, при котором параллельно выполняется последовательность многих перекрывающихся фрагментов ДНК. В этом методе небольшие фрагменты собираются в более крупные фрагменты, а затем в более крупные контиги с помощью компьютера. Затем контиги собираются в каркасы и, наконец, в хромосому. Следовательно, контиг - это непрерывный участок нуклеотидных последовательностей, тогда как каркас - это часть генома, состоящая из контигов и пробелов. И контиг, и скаффолд представляют собой реконструированные геномные последовательности.

Рекомендуем: