Ключевое различие - экзом против транскриптома
Ген содержит в себе кодирующие и некодирующие области. Кодирующие последовательности известны как экзоны, а некодирующие последовательности известны как интроны. Нуклеотидная последовательность экзонов гена представляет собой генетический код гена для синтеза конкретного белка. Следовательно, экзоны остаются в молекуле мРНК. Общая область экзона генома известна как экзом, и это важная часть генома. Генетический код генов преобразуется в генетический код молекулы мРНК, которая необходима для производства белка. Полные молекулы мРНК, транскрибируемые в клетке или популяции клеток за один раз, известны как транскриптом. Ключевое различие между экзомом и транскриптомом состоит в том, что экзом представляет собой последовательности экзонных областей генома, в то время как транскриптом представляет собой общую мРНК клетки или ткани в данный момент времени.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и ключевые различия
2. Что такое экзом
3. Что такое транскриптом
4. Сравнение бок о бок - экзом и транскриптом
5. Резюме
Что такое экзом?
Гены состоят из экзонов, интронов и регуляторных последовательностей. Экзоны - это участки гена, которые транскрибируются в последовательность мРНК во время транскрипции. Интроны и другие некодирующие области удаляются во время транскрипции. Нуклеотидная последовательность экзонов определяет генетический код гена, который синтезирует конкретный белок, который он кодирует. В мРНК белка остаются только экзоны. Набор экзонов в геноме известен как экзом организма. Он представляет собой часть генома, которая выражается в генах. У человека экзом составляет 1% генома. Это кодирующая белок часть генома человека.
Рисунок 01: Экзом
Что такое транскриптом?
Транскриптом - это совокупность всех кодирующих и некодирующих белок транскриптов (РНК) в данной ткани. Транскриптом представляет собой совокупность молекул общей мРНК, экспрессируемых генами в клетке или ткани. Транскриптом клетки может изменяться с транскриптомом другого типа клетки. Транскриптом также динамичен - он изменяется со временем в ответ как на внутренние, так и на внешние раздражители. Даже в пределах одной ткани или одного типа клеток транскриптом может измениться через несколько минут.
Транскриптом отличается от экзома организма. Транскриптом включает только экспрессированные последовательности экзома. Хотя экзом клетки остается неизменным, транскриптом отличается от клетки к ней, поскольку экспрессия генов неодинакова для всех клеток или тканей. В разных клетках и тканях экспрессируются только основные гены. Экспрессия генов - это процесс, специфичный для ткани или типа клеток. Это регулируется различными факторами, включая факторы окружающей среды. Следовательно, транскриптом может изменяться в зависимости от внешних условий окружающей среды.
Транскриптом используется в качестве предшественника для протеомных исследований. Все белки происходят из последовательностей мРНК. Трансляционные модификации могут привести к изменениям белков. Однако транскриптом предоставляет важную базовую информацию для протеомных исследований.
Рисунок 02: Транскриптом эмбриональных стволовых клеток
В чем разница между экзомом и транскриптомом?
Различать статью в середине перед таблицей
Экзом против транскриптома |
|
| Экзом - это совокупность кодирующих белок областей генов. | Транскриптом - это совокупность всех транскрибируемых РНК, включая мРНК. |
| Образец | |
| Экзом изучается на образце ДНК. | Транскриптом изучается с использованием образца РНК. |
| Метод исследования | |
| Полное секвенирование экзома - метод изучения экзома. | Секвенирование РНК - метод изучения транскриптома. |
Резюме - экзом против транскриптома
Экзоны представляют собой кодирующие последовательности генов и определяют последовательности мРНК белков. Набор этих кодирующих последовательностей (экзонов) известен как экзом организма. Гены транскрибируются в молекулы мРНК до образования белков. Суммарные молекулы мРНК клетки или ткани в любой момент времени известны как транскриптом. Транскриптом представляет собой гены, которые активно экспрессируются в мРНК в любой момент времени. Транскриптом зависит от клеток и тканей и влияет на условия окружающей среды. В этом разница между экзомом и транскриптомом.
