Ключевое различие - VNTR против STR
Исследования ДНК имеют огромную полезность для понимания и определения филогенетических отношений, диагностики генетических заболеваний и картирования геномов организмов. Несколько методов, связанных с анализом ДНК, используются для идентификации конкретного гена или последовательности ДНК в пуле неизвестной ДНК. Они известны как генетические маркеры. Генетические маркеры используются в молекулярной биологии для выявления генетических различий между людьми и видами. Тандемный повтор с переменным числом (VNTR) и короткий тандемный повтор (STR) - это два типа генетических маркеров, которые обнаруживают полиморфизм среди людей. Оба типа представляют собой некодирующие повторяющиеся ДНК, которые являются тандемными повторами. Они расположены по принципу «голова к хвосту» в хромосомах. VNTR - это участок генома, в котором короткая нуклеотидная последовательность повторяется несколько раз. STR - это еще один участок ДНК в геноме, который организован как повторяющиеся единицы, состоящие из двух-тринадцати нуклеотидов в сотни раз. Ключевое различие между VNTR и STR - количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности. Повторяющаяся единица VNTR состоит из 10–100 нуклеотидов, а повторяющаяся единица STR - от 2 до 13 нуклеотидов. VNTR и STR широко используются в судебных исследованиях.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и ключевые различия
2. Что такое VNTR
3. Что такое STR
4. Сходства между VNTR и STR
5. Сравнение бок о бок - VNTR и STR в табличной форме
6. Резюме
Что такое VNTR?
Тандемный повтор - это короткая последовательность ДНК, которая повторяется от головы до хвоста в определенном хромосомном локусе. В тандемном повторе нет другой последовательности или нуклеотида. В геноме есть несколько типов тандемных повторов. VNTR представляет собой тип тандемного повтора среди них, который имеет повторяющиеся единицы, состоящие от 10 до 100 нуклеотидов. ВНТР - это мини-спутник. Эти тандемные повторы можно найти во многих хромосомах. Они вкраплены в геном человека и расположены преимущественно в субтеломерных областях хромосом.
VNTR демонстрируют полиморфизм тандемных повторов среди индивидуумов. Длина VNTR в определенном месте хромосомы сильно различается среди людей из-за различий в количестве повторяющихся единиц, организованных в этом участке ДНК. Таким образом, VNTR может использоваться как мощный инструмент для идентификации людей, а анализ VNTR используется во многих областях, включая генетику, биологические исследования, судебную экспертизу и отпечатки пальцев ДНК. VNTR были первыми генетическими маркерами, использованными для количественной оценки приживления трансплантата костного мозга. VNTR также были первыми полиморфными маркерами, используемыми для профилирования ДНК в судебной медицине.
Рисунок 01: Вариация VNTR у шести человек
VNTR-анализ проводят с помощью полиморфизма длин рестрикционных фрагментов с последующей саузерн-гибридизацией. Следовательно, ему нужен сравнительно большой образец ДНК. Интерпретация профиля VNTR также проблематична. Из-за этих ограничений использование VNTR в судебной генетике было ограничено и заменено анализом STR.
Что такое STR?
STR - это очень повторяющийся участок ДНК, который состоит из двух-тринадцати нуклеотидных повторяющихся единиц, организованных тандемным образом. STR похож на VNTR. Но он варьируется от VNTR от количества нуклеотидов в повторяющейся последовательности и количества повторов. STR - это разновидность микроспутника.
STR-анализ, участвующий в измерении точного количества повторяющихся единиц. STR сильно различаются среди людей, как и VNT. Профили STR различаются от человека к человеку. Поэтому STR-анализ используется в молекулярной биологии для сравнения конкретных локусов ДНК из двух или более образцов. Следовательно, STR считаются мощными генетическими маркерами в молекулярной биологии. Это отличный инструмент для идентификации людей из-за их высокой степени полиморфизма и относительно небольшой длины.
В настоящее время STR являются наиболее часто используемым инструментом анализа генетического полиморфизма в судебной генетике. Большинство судебных дел включает полиморфный анализ STR. STR-локусы распространены по всему геному. В хромосомах расположены тысячи STR, которые можно использовать в судебной экспертизе. STR-анализ не включает рестрикционный полиморфизм длины, как анализ VNTR. STR-анализ не разрезает ДНК рестрикционными ферментами. Конкретные зонды используются для прикрепления желаемых участков к ДНК, и с помощью метода ПЦР определяется длина STR.
Рисунок 02: Изменение STR между образцами
В чем сходство между VNTR и STR?
- VNTR и STR - это некодирующая ДНК.
- Оба являются тандемными повторами.
- Оба обнаруживают полиморфизм среди людей из-за разницы в длине участка ДНК.
- Оба они используются в качестве мощных генетических маркеров при отпечатках пальцев ДНК и в судебно-медицинских исследованиях.
В чем разница между VNTR и STR?
Различать статью в середине перед таблицей
VNTR против STR |
|
| VNTR - это некодирующая повторяющаяся ДНК, которая имеет короткую нуклеотидную последовательность, повторяющуюся тандемным образом. | STR - это очень повторяющийся участок ДНК, который состоит из двух-тринадцати нуклеотидных повторяющихся единиц, организованных тандемным образом. |
| Размер | |
| VNTR больше, чем STR. | STR меньше, чем VNTR. |
| Количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности | |
| Повторяющаяся единица VNTR состоит из 10–100 нуклеотидов. | Повторяющаяся единица STR состоит из 2-13 нуклеотидов. |
Резюме - VNTR vs STR
VNTR и STR - два мощных генетических маркера, используемых в молекулярной биологии, особенно в области судебной генетики. VNTR - это тип мини-спутника, а STR - микроспутник. VNTR и STR - это некодирующие, очень повторяющиеся ДНК. Это тандемные повторы. Общая структура VNTR и STR одинакова. Однако количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности и длина различаются. VNTR имеет повторяющиеся последовательности от 10 до 100 нуклеотидов. STR имеет повторяющиеся последовательности, состоящие из 2-13 нуклеотидов. В этом разница между VNTR и STR.
Скачать PDF-версию VNTR vs STR
Вы можете скачать PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономных целях в соответствии с примечаниями к цитированию. Пожалуйста, скачайте PDF-версию здесь. Разница между VNTR и STR.
