Ключевое различие между BLAST и FastA заключается в том, что BLAST - это основной инструмент согласования, доступный на веб-сайте Национального центра биотехнологической информации, а FastA - это инструмент поиска сходства, доступный на веб-сайте Европейского института биоинформатики.
BLAST и FastA - это два программного обеспечения, которые широко используются для сравнения биологических последовательностей ДНК, аминокислот, белков и нуклеотидов разных видов и поиска их сходства. Эти алгоритмы были написаны с учетом скорости. Потому что, когда ученые смогли выделить ДНК в лаборатории в середине 1980-х годов, возникла необходимость в быстром сравнении и поиске идентичных генов для дальнейших исследований. Следовательно, эти два программного обеспечения были разработаны таким образом, чтобы пользователь мог выполнять быстрый поиск аналогичных последовательностей с последовательностями своих запросов.
BLAST является аббревиатурой от Basic Local Alignment Search Tool и использует локализованный подход для сравнения двух последовательностей. FastA - это программное обеспечение, относящееся к Fast A, где A означает все. Здесь программа работает с такими алфавитами, как Fast A для секвенирования ДНК и Fast P для белков. И BLAST, и FastA очень быстро сравнивают любую базу данных генома и, следовательно, очень жизнеспособны как с точки зрения денег, так и с точки зрения экономии времени.