Ключевое различие между убихинонами и цитохромами состоит в том, что убихиноны (CoQ) не являются белками, а цитохромы - белками.
Цепь переноса электронов - заключительный этап аэробного дыхания. Следовательно, это происходит во внутренней мембране митохондрий. Кроме того, он состоит из переносчиков электронов, которые способствуют образованию градиента протонов через мембрану. Помимо НАД и флавопротеинов, убихиноны и цитохромы представляют собой два типа переносчиков электронов, участвующих в цепи переноса электронов. Убихиноны представляют собой небелковые жирорастворимые гидрофобные органические молекулы, тогда как цитохромы представляют собой железосодержащие белки.