Ключевое различие между максимальной экономией и максимальной вероятностью зависит от метода, используемого при разработке филогенетического дерева. Максимальная экономия направлена на минимизацию общих состояний характера во время построения филогенетического дерева, в то время как максимальная вероятность - это статистический подход к рисованию филогенетического дерева в зависимости от вероятности между генетическими данными.
Филогения - это новый подход к классификации и номенклатуре организмов. Филогения опирается на генетические данные и эволюционные отношения. Генетические данные являются результатом секвенирования ДНК. В филогенезе классификация организмов происходит на основе общего предка. Максимальная экономия и максимальная вероятность филогенетического родства повышают точность и надежность филогенетического дерева.