Разница между зондом и праймером

2024 Автор: Mildred Bawerman | [email protected]. Последнее изменение: 2023-12-16 08:42

Ключевое различие - зонд против праймера

Молекулярный зонд представляет собой небольшой фрагмент ДНК или РНК, который распознает комплементарные последовательности ДНК или РНК и позволяет идентифицировать целевую последовательность. Праймер - это небольшой участок ДНК или РНК, который служит отправной точкой для синтеза ДНК. Праймеры и зонды гибридизуются с комплементарными нуклеотидами матричной ДНК или целевой ДНК. Однако ключевое различие между зондом и праймером заключается в том, что праймеры необходимы для репликации ДНК, в то время как зонды необходимы для обнаружения конкретных последовательностей в образце ДНК.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия

2. Что такое зонд

3. Что такое праймер

4. Сравнение бок о бок - зонд и праймер

5. Резюме

Что такое зонд?

Зонд - это небольшой фрагмент ДНК или РНК, используемый для обнаружения целевой ДНК или РНК в образце путем молекулярной гибридизации. Они также известны как молекулярные маркеры. Длина зонда может варьироваться (от 100 до 1000 оснований), а нуклеотиды зонда комплементарны части последовательности-мишени. Для простоты обнаружения зонды помечают радиоактивными изотопами, флуоресцентными красителями или антителами. Зонды связываются с комплементарными основаниями целевой последовательности и выявляют присутствие целевой ДНК или РНК в образце. Существует два основных метода маркировки зондов: маркировка концов и перевод ников. Зонды подразделяются на различные типы, включая зонды ДНК, зонды РНК, зонды cDNa и зонды синтетических олигонуклеотидов, и их получают с использованием различных методик.

Зонды являются важными инструментами во многих микробных и молекулярных областях, таких как вирусология, судебно-медицинская экспертиза, тестирование отцовства, дактилоскопия ДНК, обнаружение генетических заболеваний, RFLP, молекулярная цитогенетика, гибридизация in situ и т. Д.

Рисунок 01: Зонд с флуоресцентной меткой, используемый в FISH для обнаружения патогенов.

Что такое праймер?

Праймер - это короткий фрагмент ДНК или РНК, который служит инициатором синтеза ДНК. Фермент ДНК-полимераза добавляет нуклеотиды к 3'-ОН-группе последовательности праймера и синтезирует новую цепь, комплементарную матричной ДНК. Праймеры представляют собой очень короткие фрагменты длиной от 18 до 20 нуклеотидов. Они химически синтезированы в лаборатории для амплификации ДНК in vitro (ПЦР). Праймеры могут иметь любую последовательность нуклеотидов, поскольку они разработаны пользователем. Они синтезируются в соответствии с дополнительными основаниями матричной ДНК. Следовательно, он может иметь любую последовательность нуклеотидов. Праймеры имеют первостепенное значение для репликации ДНК, поскольку ДНК-полимераза не может синтезировать новую ДНК без уже существующего фрагмента ДНК. При разработке праймеров для ПЦР необходимо учитывать следующее:

• Праймеры должны содержать нуклеотиды, комплементарные фланкирующему концу ДНК, которая должна амплифицироваться.
• Грунтовки должны иметь температуру плавления от 55 до 65 ⁰ C.
• Содержание G и C должно составлять от 50 до 60%.

В ПЦР используются два праймера: прямой и обратный для репликации обеих цепей ДНК образца. Праймеры обычно используются для проведения ПЦР и секвенирования ДНК.

Рисунок 02: Отжиг праймера в ПЦР

В чем разница между Probe и Primer?

Различать статью в середине перед таблицей

Зонд против праймера
Зонд - это небольшой фрагмент ДНК / РНК, используемый для обнаружения присутствия целевой последовательности в образце путем молекулярной гибридизации.	Праймер - это небольшой участок ДНК или РНК, который служит отправной точкой для репликации ДНК.
Функция
Это обнаруживает наличие определенной последовательности в образце ДНК или РНК.	Это действует как отправная точка для синтеза ДНК.
Длина
Длина может быть в диапазоне от 100 до 1000 баз.	Длина обычно составляет около 18-20 оснований.
Связывание с дополнительной последовательностью
Зонд гибридизуется с комплементарными основаниями целевой последовательности.	Праймеры отжигаются с комплементарными основаниями цепей ДНК.
Маркировка
Зонды маркируются для облегчения обнаружения	Праймеры обычно не маркируются
Использование в ПЦР
Зонды не используются в ПЦР	Праймеры используются в ПЦР

Резюме - зонд против праймера

Зонд - это небольшой фрагмент последовательности ДНК или РНК, который можно гибридизировать с комплементарными нуклеотидами для обнаружения целевой последовательности в образце. Зонды метят радиоактивно, иммунологически или флуоресцентно, чтобы увидеть наличие целевой последовательности. Праймер - это очень маленький фрагмент ДНК или РНК, который служит отправной точкой для амплификации ДНК in vitro. ДНК-полимераза идентифицирует праймер 3'-группы ОН и инициирует построение новой цепи, комплементарной матрице. Зонды и праймеры работают аналогично за счет гибридизации с комплементарными нуклеотидами. Таким образом, ключевое различие между зондом и праймером заключается в их основной функции.