Разница между протеомикой и транскриптомикой

2024 Автор: Mildred Bawerman | [email protected]. Последнее изменение: 2023-12-16 08:42

Ключевое различие - протеомика против транскриптомики

Омная технология - это современная тенденция, при которой различные биомолекулы организма рассматриваются как единое целое с точки зрения их свойств и функций. У технологии omic есть широкий спектр приложений. Различные омики биологического образца включают геномику, протеомику, транскриптомику и метаболомику. Протеомика подразумевает полное изучение всех белков живого организма. Он определяется как набор всех экспрессируемых белков в организме, его структурные и функциональные свойства. Таким образом, полный набор белков составляет протеом. Транскриптомика - это полное исследование всех молекул информационной РНК (мРНК), присутствующих в живом организме. Таким образом, транскриптомика имеет дело с генами, которые активно экспрессируются в живом организме. Полный набор мРНК в живом организме называется транскриптомом. Ключевое различие между протеомикой и транскриптомикой основано на типе биомолекулы. В протеомике изучается общий набор экспрессируемых белков в живом организме, тогда как в транскриптомике изучается общая мРНК живого организма.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные различия

2. Что такое протеомика

3. Что такое транскриптомика

4. Сходства между протеомикой и транскриптомикой

5. Сравнение бок о бок - протеомика и транскриптомика в табличной форме

6. Резюме

Что такое протеомика?

Термин протеомика был введен в обращение в 1995 году и первоначально определялся как общий белковый комплемент в клетке, ткани или организме. С развитием протеомных исследований он был затем изменен, чтобы рассматриваться как общий термин, в который были включены многие области исследований. В настоящее время в рамках темы протеомики изучаются структура, ориентация, функции, ее взаимодействия, ее модификации, ее применение и важность белков. Поэтому в настоящее время в области протеомики проводится много исследований.

Первые протеомные исследования были проведены для определения содержания белка в Escherichia coli. Картирование общего содержания белка было выполнено с использованием двумерных (2D) гелей. После успеха ученые перешли к определению общего содержания белка в животных, таких как морские свинки и мыши. В настоящее время картирование белков человека выполняется с помощью 2D-гель-электрофореза.

Применение протеомики

Изучение протеомики дает множество преимуществ, поскольку белки являются определяющими молекулами большей части активности из-за их каталитических свойств. Таким образом, изучение целых белков может предоставить информацию о состоянии здоровья организма. Некоторые приложения есть;

1. Аннотации генома: изучая содержание белка в организме, можно определить точные геномы, ответственные за активное белковое соединение. В этом сценарии важны результаты всей геномики, транскриптомики и протеомики.
2. Выявление заболеваний / диагностика: протеомика используется для идентификации болезненного состояния путем сравнения здоровых и больных.
3. Чтобы осуществить экспрессию белка, изучаемого в ходе экспериментов.
4. Модификации белков и исследования взаимодействия: чтобы использовать белки в условиях in vitro или in vivo, определить условия хранения этих экстрагированных белков и изучить поведение белка методами in vitro, in vivo и in silico.

Рисунок 01: Протеомика

В протеомике используются разные техники

1. Экстракция общего белка и разделение белков с помощью 2D гель-электрофореза. Белки также можно разделить с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
2. Секвенирование экстрагированных белков с использованием таких методов, как метод секвенирования Эдмунда или масс-спектрометрия.
3. После идентификации последовательностей структурные и функциональные свойства содержания белка анализируются с использованием компьютерного программного обеспечения и инструментов биоинформатики.

Что такое транскриптомика?

Термин транскриптом был придуман недавно. Транскриптомика - это исследование общего содержания мРНК в организме. Общая мРНК - это экспрессируемая ДНК в живом организме или клетке. Полная коллекция мРНК называется транскриптомом.

Шаги к анализу транскриптома включают:

1. Экстракция РНК, разделение мРНК с помощью колоночной гель-хроматографии с шариками поли DT.
2. Выполнено секвенирование мРНК.

Технология микрочипов - один из распространенных способов идентификации транскриптома организма. Техника микроматрицы включает в себя пластину зонда с дополнительными цепями транскриптома. После гибридизации мРНК, присутствующая в организме или клетках, может быть охарактеризована.

Рисунок 02: Транскриптомические методы

Транскриптомика сейчас широко используется в медицине. Диагностика заболеваний и составление профилей болезней - основные области, в которых используется транскриптомика. Анализируя транскриптом организма, можно идентифицировать чужеродную мРНК, и, если есть какие-либо инфекции, ее можно идентифицировать. Некодирующие РНК могут быть отделены с помощью транскриптомных технологий. А также можно контролировать экспрессию генов при различных стрессах окружающей среды.

В чем сходство между протеомикой и транскриптомикой?

• Оба являются частью концепции омической технологии.
• Оба они используются для диагностики заболеваний и характеристики болезней организма.
• Обе области исследования включали извлечение биомолекулы, разделение биомолекулы и этапы секвенирования.

В чем разница между протеомикой и транскриптомикой?

Различать статью в середине перед таблицей

Протемика против транскриптомики
Протеомика подразумевает полное изучение всех белков живого организма.	Транскриптомика - это полное исследование всех молекул информационной РНК (мРНК), присутствующих в живом организме.
Изученный тип биомолекулы
Белки изучаются в протеомике.	мРНК изучаются в транскриптомике.
Факторы изучаемые
Структура, функции, взаимодействия, модификации и применения белков изучаются в протеомике.	Структура последовательности, взаимодействия с окружающей средой и применения мРНК изучаются в транскриптомике.

Резюме - Протеомика против транскриптомики

Омики играют важную роль в области наук о жизни. Протеомика относится к изучению протеома, который формирует полные коллекции белков в клетке или организме. Транскриптомика относится к изучению транскриптома, который представляет собой полный набор экспрессируемой ДНК в форме мРНК. Две области исследования, протеомика и транскриптомика, возникли после введения геномики и в настоящее время широко используются в медицинской диагностике, а также в характеристике и скрининге организмов. В этом разница между протеомикой и транскриптомикой.

Скачать PDF-файл Proteomics vs Transcriptomics

Вы можете загрузить PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономных целях в соответствии с примечанием к цитированию. Пожалуйста, скачайте PDF-версию здесь: Разница между протеомикой и транскриптомикой