Ключевое различие - протеомика против транскриптомики
Омная технология - это современная тенденция, при которой различные биомолекулы организма рассматриваются как единое целое с точки зрения их свойств и функций. У технологии omic есть широкий спектр приложений. Различные омики биологического образца включают геномику, протеомику, транскриптомику и метаболомику. Протеомика подразумевает полное изучение всех белков живого организма. Он определяется как набор всех экспрессируемых белков в организме, его структурные и функциональные свойства. Таким образом, полный набор белков составляет протеом. Транскриптомика - это полное исследование всех молекул информационной РНК (мРНК), присутствующих в живом организме. Таким образом, транскриптомика имеет дело с генами, которые активно экспрессируются в живом организме. Полный набор мРНК в живом организме называется транскриптомом. Ключевое различие между протеомикой и транскриптомикой основано на типе биомолекулы. В протеомике изучается общий набор экспрессируемых белков в живом организме, тогда как в транскриптомике изучается общая мРНК живого организма.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные различия
2. Что такое протеомика
3. Что такое транскриптомика
4. Сходства между протеомикой и транскриптомикой
5. Сравнение бок о бок - протеомика и транскриптомика в табличной форме
6. Резюме
Что такое протеомика?
Термин протеомика был введен в обращение в 1995 году и первоначально определялся как общий белковый комплемент в клетке, ткани или организме. С развитием протеомных исследований он был затем изменен, чтобы рассматриваться как общий термин, в который были включены многие области исследований. В настоящее время в рамках темы протеомики изучаются структура, ориентация, функции, ее взаимодействия, ее модификации, ее применение и важность белков. Поэтому в настоящее время в области протеомики проводится много исследований.
Первые протеомные исследования были проведены для определения содержания белка в Escherichia coli. Картирование общего содержания белка было выполнено с использованием двумерных (2D) гелей. После успеха ученые перешли к определению общего содержания белка в животных, таких как морские свинки и мыши. В настоящее время картирование белков человека выполняется с помощью 2D-гель-электрофореза.
Применение протеомики
Изучение протеомики дает множество преимуществ, поскольку белки являются определяющими молекулами большей части активности из-за их каталитических свойств. Таким образом, изучение целых белков может предоставить информацию о состоянии здоровья организма. Некоторые приложения есть;
- Аннотации генома: изучая содержание белка в организме, можно определить точные геномы, ответственные за активное белковое соединение. В этом сценарии важны результаты всей геномики, транскриптомики и протеомики.
- Выявление заболеваний / диагностика: протеомика используется для идентификации болезненного состояния путем сравнения здоровых и больных.
- Чтобы осуществить экспрессию белка, изучаемого в ходе экспериментов.
- Модификации белков и исследования взаимодействия: чтобы использовать белки в условиях in vitro или in vivo, определить условия хранения этих экстрагированных белков и изучить поведение белка методами in vitro, in vivo и in silico.
Рисунок 01: Протеомика
В протеомике используются разные техники
- Экстракция общего белка и разделение белков с помощью 2D гель-электрофореза. Белки также можно разделить с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
- Секвенирование экстрагированных белков с использованием таких методов, как метод секвенирования Эдмунда или масс-спектрометрия.
- После идентификации последовательностей структурные и функциональные свойства содержания белка анализируются с использованием компьютерного программного обеспечения и инструментов биоинформатики.
Что такое транскриптомика?
Термин транскриптом был придуман недавно. Транскриптомика - это исследование общего содержания мРНК в организме. Общая мРНК - это экспрессируемая ДНК в живом организме или клетке. Полная коллекция мРНК называется транскриптомом.
Шаги к анализу транскриптома включают:
- Экстракция РНК, разделение мРНК с помощью колоночной гель-хроматографии с шариками поли DT.
- Выполнено секвенирование мРНК.
Технология микрочипов - один из распространенных способов идентификации транскриптома организма. Техника микроматрицы включает в себя пластину зонда с дополнительными цепями транскриптома. После гибридизации мРНК, присутствующая в организме или клетках, может быть охарактеризована.
Рисунок 02: Транскриптомические методы
Транскриптомика сейчас широко используется в медицине. Диагностика заболеваний и составление профилей болезней - основные области, в которых используется транскриптомика. Анализируя транскриптом организма, можно идентифицировать чужеродную мРНК, и, если есть какие-либо инфекции, ее можно идентифицировать. Некодирующие РНК могут быть отделены с помощью транскриптомных технологий. А также можно контролировать экспрессию генов при различных стрессах окружающей среды.
В чем сходство между протеомикой и транскриптомикой?
- Оба являются частью концепции омической технологии.
- Оба они используются для диагностики заболеваний и характеристики болезней организма.
- Обе области исследования включали извлечение биомолекулы, разделение биомолекулы и этапы секвенирования.
В чем разница между протеомикой и транскриптомикой?
Различать статью в середине перед таблицей
Протемика против транскриптомики |
|
| Протеомика подразумевает полное изучение всех белков живого организма. | Транскриптомика - это полное исследование всех молекул информационной РНК (мРНК), присутствующих в живом организме. |
| Изученный тип биомолекулы | |
| Белки изучаются в протеомике. | мРНК изучаются в транскриптомике. |
| Факторы изучаемые | |
| Структура, функции, взаимодействия, модификации и применения белков изучаются в протеомике. | Структура последовательности, взаимодействия с окружающей средой и применения мРНК изучаются в транскриптомике. |
Резюме - Протеомика против транскриптомики
Омики играют важную роль в области наук о жизни. Протеомика относится к изучению протеома, который формирует полные коллекции белков в клетке или организме. Транскриптомика относится к изучению транскриптома, который представляет собой полный набор экспрессируемой ДНК в форме мРНК. Две области исследования, протеомика и транскриптомика, возникли после введения геномики и в настоящее время широко используются в медицинской диагностике, а также в характеристике и скрининге организмов. В этом разница между протеомикой и транскриптомикой.
Скачать PDF-файл Proteomics vs Transcriptomics
Вы можете загрузить PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономных целях в соответствии с примечанием к цитированию. Пожалуйста, скачайте PDF-версию здесь: Разница между протеомикой и транскриптомикой
