Ключевое различие между эндоцитозом и экзоцитозом заключается в том, что эндоцитоз переносит вещества в клетку, а экзоцитоз переносит вещества за пределы клетки.
Клетка имеет клеточную мембрану, которая действует как барьер между внутренним пространством клетки и внешней средой. Следовательно, имея такую мембрану, клеткам необходим какой-то транспортный механизм для связи с внешней средой. Например, клеткам необходимо получать питательные вещества и выводить отходы из клетки. Для этого у клеток есть четыре основных механизма транспортировки: диффузия, осмос, активный транспорт и объемный транспорт. Диффузия и осмос являются пассивными процессами, тогда как активный транспорт и объемный транспорт являются активными процессами, потребляющими энергию. Эндоцитоз и экзоцитоз - это два типа механизмов массовой транспортировки, которые транспортируют большие частицы через плазматическую мембрану либо из клетки во внешнюю среду, либо из внешней среды в клетку. Оба эти механизма образуют мембраносвязанные везикулы как средство транспортировки.