Ключевое различие между митохондриальной ДНК и хлоропластной ДНК заключается в том, что митохондриальная ДНК присутствует внутри митохондрий эукариотических клеток, тогда как хлоропластная ДНК присутствует внутри хлоропластов растительных клеток.
Митохондрии и хлоропласты - две важные мембраносвязанные органеллы в эукариотических клетках. Митохондрии - это электростанции клеток. С другой стороны, хлоропласты являются участками фотосинтеза у растений. Считается, что как митохондрии, так и хлоропласты произошли от прокариотических клеток до эукариотических клеток в результате эндосимбиоза. Эти две органеллы содержат собственную ДНК. Хотя эта ДНК не является ядерной ДНК клетки и не важна для функционирования клетки, она важна для некоторых свойств их собственных клеточных органелл.