Ключевое различие между гибридами ДНК-РНК и дцДНК состоит в том, что гибриды ДНК-РНК представляют собой двухцепочечные нуклеотиды, состоящие из одной цепи ДНК и одной комплементарной цепи РНК, тогда как дцДНК представляет собой двухцепочечную ДНК, состоящую из двух комплементарных цепей ДНК.
В нативном состоянии ДНК является двухцепочечной. Он имеет две дополнительные цепи ДНК, связанные водородными связями. РНК по своей нативной структуре одноцепочечная. В некоторых случаях РНК образуют дуплексы с ДНК. Они известны как гибриды ДНК-РНК. В основном они образуются при транскрипции и размножении онкогенных РНК-вирусов. По сравнению с дцДНК гибриды ДНК-РНК более стабильны.