Ключевое различие - кДНК против геномной библиотеки
Есть два основных типа библиотек ДНК, созданных учеными с использованием методов генной инженерии. Это библиотека кДНК и геномная библиотека. Ключевое различие между кДНК и геномной библиотекой заключается в том, что библиотека кДНК содержит клонированную комплементарную ДНК общей мРНК организма, тогда как библиотека геномной ДНК содержит клонированные фрагменты всего генома организма. Библиотека геномной ДНК больше библиотеки кДНК.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные различия
2. Что такое библиотека кДНК
3. Что такое геномная библиотека
4. Сравнение бок о бок - кДНК и геномная библиотека
5. Резюме
Что такое геномная библиотека?
Библиотека геномной ДНК - это коллекция клонов, несущих фрагменты общей геномной ДНК организма. Он содержит всю геномную ДНК этого организма, включая кодирующие и некодирующие последовательности. Создание геномной библиотеки выполняется с помощью технологии рекомбинантной ДНК с последующим клонированием (генная инженерия). Как показано на рисунке 01, в построение входят различные этапы. Процесс начинается с выделения геномной ДНК. Используя подходящий протокол выделения ДНК, следует выделить полную геномную ДНК организма. Затем ДНК необходимо преобразовать в приемлемые размеры или в конкретные фрагменты с помощью эндонуклеаз рестрикции (ферментов, разрезающих ДНК). Фрагментированную ДНК следует вставлять в векторы с помощью ДНК-лигаз (ферментов, соединяющих ДНК). Вектор - это самовоспроизводящийся организм. Плазмиды и бактериофаги являются обычно используемыми векторами в технологии рекомбинантной ДНК. Эти лигированные векторы известны как рекомбинантные молекулы ДНК, поскольку они несут как собственные, так и встроенные последовательности ДНК. Рекомбинантные векторы добавляют к бактерии-хозяину и заставляют поглощать рекомбинантные векторы внутри бактериальной клетки. Бактерии с рекомбинантными векторами (плазмидами) следует выращивать в культуральной среде. Во время размножения бактерий бактериальная ДНК вместе с рекомбинантными плазмидами реплицирует их геномы и производит клоны. Эти клоны содержат весь геном исходного организма. Следовательно, это называется геномной библиотекой. Плазмиды можно легко отделить от бактериальной хромосомной ДНК, чтобы построить геномную библиотеку этого организма. Если конкретный организм содержит интересующие гены,его легко обнаружить в геномной библиотеке путем гибридизации с использованием молекулярных зондов (маркеров).
Геномные библиотеки важны для изучения геномной структуры и функции, конкретных генов, местоположения генов, картирования генов, мутаций, секвенирования генов, идентификации новых терапевтических генов и т. Д.
Рисунок_1: Создание геномной библиотеки
Что такое библиотека кДНК?
Библиотека кДНК - это коллекция клонов комплементарной ДНК (кДНК), синтезированных из общей мРНК организма. Процедура строительства включает в себя разные этапы. Очистка общей мРНК из организма - это первый шаг. Изолированная мРНК преобразуется в нити кДНК с помощью процесса, называемого обратной транскрипцией. Обратной транскрипции способствует фермент, называемый обратной транскриптазой. Он использует небольшой 3 'праймер и инициирует синтез первой цепи кДНК, комплементарной цепи матричной мРНК. Полученная двухцепочечная кДНК превращается в более мелкие фрагменты с использованием эндонуклеаз рестрикции и вставляется в подходящие векторы. Эти сконструированные рекомбинантные молекулы затем добавляются в организм-хозяин и выращиваются в культуральной среде для получения клонов. Коллекция клонов, содержащих фрагменты кДНК организма, известна как библиотека кДНК. Полностью нарезанная зрелая мРНК не содержит интронов и регуляторных областей. Следовательно, некодирующие фрагменты не присутствуют в библиотеках кДНК, в отличие от геномной библиотеки.
Библиотеки кДНК важны для анализа кодирующих областей, функций генов, экспрессии генов и т. д.
Рисунок_2: Создание библиотеки кДНК
В чем разница между кДНК и геномной библиотекой?
Различать статью в середине перед таблицей
кДНК против геномной библиотеки |
|
| Библиотека кДНК - это коллекция клонов, несущих ДНК, комплементарную мРНК организма. | Геномная библиотека - это коллекция клонов, несущих полную геномную ДНК организма. |
| Кодирование против некодирующих последовательностей | |
| библиотека кДНК содержит только кодирующие последовательности; он не содержит интронов. | Геномная библиотека состоит из всей геномной ДНК, включая некодирующую (интронную и регуляторную) ДНК. |
| Размер | |
| Библиотека кДНК небольшая. | Геномная библиотека большая. |
| Исходный материал | |
| Исходный материал - мРНК | Исходный материал - ДНК. |
| Привлечение обратной транскрипции. | |
| Обратная транскрипция происходит при синтезе первой цепи кДНК. | Обратной транскрипции не бывает. |
Резюме - кДНК и геномная библиотека
Геномная библиотека представляет собой популяцию клонов, несущих фрагментированную полную геномную ДНК организма. Библиотека кДНК представляет собой популяцию клонов, несущих комплементарную ДНК общей мРНК организма. Клон кДНК содержит только последовательности, обнаруженные в мРНК, тогда как геномный клон содержит последовательности всего генома. В этом разница между кДНК и геномной библиотекой.
