Ключевое различие - YAC против фагового вектора M13
Клонирование ДНК - важный процесс, который позволяет размножать важные фрагменты ДНК организмов. Это требует соединения специфической ДНК с векторной ДНК для создания рекомбинантной ДНК, которая трансформируется в организм-хозяин. Вектор - это молекула ДНК, которая действует как средство переноса чужеродного генетического материала в другую клетку или организм. Он должен быть способен реплицироваться внутри организма-хозяина и производить множество копий рекомбинантной ДНК. При клонировании ДНК используются разные типы векторов. Искусственная хромосома дрожжей (YAC) и фаговый вектор M13 - это два типа среди них. Ключевое различие между фаговым вектором YAC и M13 заключается в том, что YAC представляет собой искусственную хромосому, которая реплицируется в дрожжевых клетках, тогда как фаговый вектор M13 представляет собой одноцепочечную кольцевую ДНК бактериофага M13, которая реплицируется в клетках E Coli.
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое YAC
3. Что такое фаговый вектор M13
4. Параллельное сравнение - YAC и фаговый вектор M13
5. Резюме
Что такое вектор YAC?
YAC - это искусственно построенная хромосома, которая обладает способностью нести большой сегмент чужеродной ДНК и реплицироваться в дрожжевых клетках. Он имеет центромеры, теломеры и автономно реплицирующиеся последовательности, необходимые для репликации и стабильности. YAC также должен нести селективный маркер или маркеры и сайты рестрикции, чтобы сделать его эффективным вектором клонирования. Большие последовательности от 1000 до 2000 т.п.н. могут быть вставлены в YAC и перенесены в дрожжи.
Рисунок 01: Вектор YAC
Что такое фаговый вектор M13?
Бактериофаг M13 - это вирус, который инфицирует кишечную палочку и размножается в ней. Геном бактериофага M13 имеет небольшой размер, около 6,7 т.п.н. Это одноцепочечная кольцевая ДНК с положительным смыслом. Этот вирус специфически заражает бактерии E Coli через F. pilus. Как только он входит в оцДНК в бактерию, он синтезирует свою комплементарную цепь и становится дцДНК или репликативной формой (RF) M13. RF может вести себя как плазмида в организме хозяина. ДцДНК реплицируется в E Coli и производит оцДНК, несущую новые фаги. Эти новые фаги непрерывно высвобождаются из кишечной палочки, не убивая клетку-хозяина. Однако инфекция замедляет рост кишечной палочки. дцДНК можно выделить из бактериальных клеток и использовать в качестве векторов при клонировании ДНК. Они известны как фаговые векторы M13. Ими можно легко манипулировать и использовать аналогично плазмидным векторам.
Присущая этим фагам M13 способность инфицирования служит хорошей квалификацией для использования в качестве вектора при клонировании генов. При превращении M13 в вектор в его геном должны быть включены несколько элементов. Они представляют собой ген белка lac-репрессора (lac I), проксимальную к оператору область гена lac Z, промотор lac и сайт множественного клонирования (полилинкер). Когда дцДНК M13 используется в качестве векторов, ее можно рассматривать как плазмидный вектор. Однако использование оцДНК M13 имеет преимущества при секвенировании ДНК и сайт-направленном мутагенезе.
Поскольку вектор фага M13 несет несколько сайтов клонирования в области lacZ, рекомбинированные векторы можно легко идентифицировать с помощью скрининга синих / белых колоний на чашках с агаром, содержащих IPTG и X-Gal. Синие бляшки, образующиеся на пластинах, не содержат рекомбинированных фагов. Следовательно, для клонирования можно выбрать фаги со вставками.
Рисунок 02: Бактериофаг M13
В чем разница между YAC и M13 Phage Vector?
Различать статью в середине перед таблицей
YAC против фагового вектора M13 |
|
YAC - это генно-инженерная хромосома, которая обладает способностью нести большой сегмент чужеродной ДНК и реплицироваться в клетках дрожжей. | Фаговый вектор M13 представляет собой вирусный вектор, разработанный бактериофагом M13, который используется для вставки чужеродной ДНК в E. Coli. |
Цель | |
YAC были разработаны для клонирования больших фрагментов геномной ДНК в дрожжи. | Фаговые векторы M13 используются для вставки чужеродной ДНК в E Coli. |
Вставить длину | |
YAC могут содержать геномные вставки размером с мегабазу (1000–2000 т.п.н.). | Размер вставок около 1500 бит / с. |
строительство | |
ДНК YAC трудно очистить в неповрежденном виде, и для создания векторной системы YAC требуется высокая концентрация. | Это происходит через циклическую фотосинтетическую электронную цепь. |
Стабильность | |
YAC нестабилен. | Фаги M13 легко извлекаются. |
Размер | |
Ферменты - это более крупные молекулы. | Фаги M13 более стабильны, чем YAC. |
Резюме - YAC против фагового вектора M13
YAC - это искусственно созданная векторная система, использующая определенный участок дрожжевой хромосомы для вставки больших сегментов генетического материала в дрожжевые клетки. Фаговый вектор M13 представляет собой векторную систему, полученную из бактериофага M 13, который использует E. coli в качестве организма-хозяина. Это основное различие между YAC и M13 Phage Vector. Оба одинаково полезны в технологии рекомбинантной ДНК и клонировании генов.